10 ans se sont écoulés depuis la confrontation entre Kira et L. Une fois de plus, le Shinigami envoie des Death Note au sol et à cause de cela, le monde tombe bientôt dans le chaos. Tsukuru est membre de l'équipe spéciale Death Note avec 6 autres enquêteurs dont Matsuda qui a vécu l'affaire Kira d'il y a 10 ans. Des meurtres de masse causés par la Death Note ont lieu à Wall Street aux États-Unis, à Shibuya au Japon et dans d'autres endroits. Le détective privé de renommée mondiale Ryuzaki, qui est le successeur légitime de L, enquête également sur les meurtres de masse. Ils découvrent que 6 Death Note existent dans le monde. Un virus informatique appelé Kira se répand dans le monde. Un message dans le virus Kira dit de rendre les 6 Death Note. Une personne qui possède 6 Death Note envahit le monde. La confrontation commence entre la personne qui veut la renaissance de Kira et les personnes qui veulent l'arrêter.