Après le massacre vicieux de sa famille par le mercenaire Sub-Zero, Hanzo Hasashi est exilé dans le Netherrealm. Là, en échange de sa servitude envers le sinistre Quan Chi, il a une chance de venger sa famille – et est ressuscité en tant que Scorpion, une âme perdue déterminée à se venger. De retour sur Earthrealm, Lord Raiden rassemble une équipe de guerriers d’élite – le moine Shaolin Liu Kang, l’officier des forces spéciales Sonya Blade et la star d’action Johnny Cage – une bande de héros improbable avec une chance de sauver l’humanité. Pour ce faire, ils doivent vaincre la horde de gladiateurs de Shang Tsung et régner sur le tournoi Mortal Kombat.