Jun, un garçon replié sur lui-même, qui vit seul avec sa sœur et passe son temps à acheter des objets gothiques sur Internet, reçoit un jour une étrange malle contenant une poupée. Mais pas n'importe quelle poupée : celle-ci parle, marche (et lui donne des claques), elle s'appelle Shinku et fait partie des 7 poupées Rozen Maiden. Leur but est de devenir Alice, la poupée parfaite, mais pour cela elles doivent jouer à un jeu appelé le Alice Game, qui leur permet de prendre la roza mistica (l'âme) de la poupée perdante et de devenir peu à peu Alice...