Liones Yelistratova est la princesse d'un petit pays qui se rend à Hokkaido à ALCA, un établissement scolaire où sont formés les Logicalists qui ont pour mission de préserver la paix mondiale. Notre héroïne fait son entrée dans la classe S où elle rencontrera des camarades de classes toutes différentes les unes des autres, à commencer par Nina Alexandrovena.